Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX2P52951 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms