Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms