Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK8P49336 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK8P49336 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK8P49336 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK8P49336 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms