Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms