Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTRNP46939 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTRNP46939 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTRNP46939 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTRNP46939 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTRNP46939 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms