Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-1P43699 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX2-1P43699 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms