Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms