Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms