Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD13P35453 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms