Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPC1P35052 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPC1P35052 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms