Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms