Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC27P30260 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC27P30260 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms