Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5AP29375 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms