Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID4AP29374 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID4AP29374 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms