Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms