Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMLP26374 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms