Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YY1P25490 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YY1P25490 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YY1P25490 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YY1P25490 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YY1P25490 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YY1P25490 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YY1P25490 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YY1P25490 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YY1P25490 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YY1P25490 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YY1P25490 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YY1P25490 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YY1P25490 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YY1P25490 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YY1P25490 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms