Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms