Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms