Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERBB3P21860 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms