Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms