Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms