Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms