Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms