Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms