Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms