Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCRP11274 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCRP11274 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCRP11274 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCRP11274 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCRP11274 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCRP11274 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCRP11274 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCRP11274 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCRP11274 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCRP11274 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms