Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHGAP10645 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHGAP10645 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHGAP10645 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHGAP10645 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms