Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms