Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI3P10071 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GLI3P10071 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GLI3P10071 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI3P10071 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI3P10071 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms