Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms