Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR29P0C7W0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR29P0C7W0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR29P0C7W0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR29P0C7W0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR29P0C7W0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms