Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPM2P07951 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPM2P07951 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM2P07951 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM2P07951 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPM2P07951 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms