Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CSN3P07498 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CSN3P07498 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms