Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms