Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA1P02647 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOA1P02647 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms