Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPLNO95428 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPLNO95428 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms