Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPO95166 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms