Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLIT2O94813 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms