Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOX1O75936 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms