Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIPSNAP2O75323 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms