Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSCO60682 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSCO60682 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSCO60682 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSCO60682 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSCO60682 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms