Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms