Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSI1O43347 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSI1O43347 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSI1O43347 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSI1O43347 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSI1O43347 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MSI1O43347 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms