Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCP110O43303 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms