Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF113AO15541 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms