Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms