Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNM1O00562 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNM1O00562 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNM1O00562 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNM1O00562 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNM1O00562 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms