Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBAG9O00559 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms