Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms